がん遺伝子パネル検査とは

　がん遺伝子パネル検査は、遺伝子の解析結果から治療方針を選択するための検査です。全ての遺伝子または一部の遺伝子について、「塩基置換・挿入／欠失※1」「遺伝子増幅・欠失※2」「遺伝子融合※3」「遺伝子発現」などを、次世代シークエンサーを用いて解析し、それらのデータを専門家による会議（エキスパートパネル）で包括的に解釈した結果から、治療方針を選択します。この検査では、一度に数十から数百もの遺伝子変化を調べることができます。薬物療法の治療効果を予測するのが主な目的ですが、承認薬の治療効果を予測するために遺伝子を調べる「コンパニオン診断」とは異なり、標準治療以外の治療に用いられる薬剤の効果についても検査結果から検討されることがあります。

塩基置換

　DNAは、「A」「G」「C」「T」の4種類の塩基が意味を持った並び順で長く連なり構成されています。特定の塩基が何らかの原因で、他の塩基に変わることを「塩基置換」といいます。

挿入

　何らかの原因でDNAの一部の塩基の並び（塩基配列）が追加され、塩基数が変化する（増える）ことを「挿入」といいます。

欠失

　何らかの原因でDNAの一部の塩基配列が欠けて、塩基数が変化する（減る）ことを「欠失」といいます。

遺伝子増幅

　何らかの原因である特定の遺伝子の数が増えることを「遺伝子増幅」といいます。

遺伝子融合

　何らかの原因で複数の異なる遺伝子が融合することを「遺伝子融合」といいます。遺伝子融合の結果、新たな機能を持つ遺伝子となる場合もあります。

遺伝子発現

　遺伝子からタンパク質が作られるプロセスのことを「遺伝子発現」といいます。同じ遺伝子でも、遺伝子発現量は、組織や細胞の状態などにより異なる場合があります。

※1～3：遺伝子変異の種類の詳細は、遺伝性疾患プラスの「遺伝子変異にはどのようなものがありますか？」を参照ください。

検査対象者と検査可能施設

　がん遺伝子パネル検査は、「がんゲノム医療中核病院」「がんゲノム医療拠点病院」「がんゲノム医療連携病院」で受けることができます。

　対象となるのは、「標準治療がない固形がん」「局所進行または転移があり、標準治療が終了した（終了見込み含む）固形がん」で、薬物療法を希望する患者さんです。

がん遺伝子パネル検査の流れ

　がん細胞（がん組織）および血液を採取し、塩基配列を高速で読み出す遺伝子解析装置（次世代シークエンサー）を用いて、がん細胞のゲノム解析を行います。解析結果が出たら、複数の領域の専門家が集まり、その結果にどのような意義があるかを検討します。この検討会議を、「エキスパートパネル」と言います。意義を含めた結果はレポートにまとめられ、これを用いて担当医が患者さんに説明を行います。

がん遺伝子パネル検査の流れ

がん遺伝子パネル検査の種類と特徴

　2023年8月現在、がん遺伝子パネル検査として保険適用されているのは、「OncoGuide NCC オンコパネルシステム」「FoundationOne CDx がんゲノムプロファイル」「オンコマイン Dx Target Test マルチ CDxシステム」「GenMineTOP がんゲノムプロファイリングシステム」の4つです。「Todai Onco Panel」は、先進医療Bとして実施され、現在保険適用に向けて準備が行われています。

OncoGuide NCC オンコパネルシステム

　日本人のがん患者さんで見られる、124個の遺伝子の変異（変異・増幅）について、次世代シークエンサーを用いて1回の検査で調べることができます。このうち13の遺伝子は、再編成についても調べることができます。また、合計変異出現率（TMB：腫瘍変異負荷）も算出可能です。TMBは、がん細胞のゲノムに生じた遺伝子変異のおおよその量です。TMBが多いと、細胞が持つ遺伝子変異を修復する機能に異常があり、がんが発生しやすいと考えられています。

　体細胞遺伝子の変化と生殖細胞系列の遺伝子変化も区別することができます。生殖細胞は、遺伝情報を親から子へ伝える役割をもつ細胞です。体細胞は、生殖細胞以外の全ての細胞のことです。体細胞遺伝子変異は、後天的な原因で発生したがん細胞における遺伝子の変化で、生殖細胞系列の遺伝子変化は、生まれつき持っている遺伝子の変化です。生殖細胞系列の遺伝子に変化がある場合、遺伝性のがんとされ、その例として、遺伝性乳がん卵巣がんの原因となる「BRCA1/2遺伝子」や、リンチ症候群の原因となる「ミスマッチ修復遺伝子」などが挙げられます。保険診療の対象です。

FoundationOne CDx がんゲノムプロファイル

　がんの診断や治療に関連する324個の遺伝子が搭載されており、変異（塩基置換、挿入／欠失、コピー数異常、再編成）、マイクロサテライト不安定性（MSI）、TMBなどを調べることができます。さらに、「非小細胞肺がん」「乳がん」「大腸がん」「悪性黒色腫」「固形がん」などに対するコンパニオン診断としての機能を持っているのが特徴です。保険診療の対象です。

GenMineTOP がんゲノムプロファイリングシステム

　固形がん患者さんの腫瘍組織検体から抽出したDNAとRNA、並びに同一患者さんの血液（がんではない部分の細胞）から抽出したDNAを用いて比較（ペア解析）することで、がんの診断や治療に関連する737のDNA変異（塩基置換、挿入／欠失、コピー数異常）の検出、RNA変異（融合、エクソンスキッピング）の検出、およびRNAの発現量の情報を一括取得することができます。

Todai OncoPanel

　Todai OncoPanelは、DNAだけでなくRNAも解析対象としているのが特徴です。DNAパネル478遺伝子とRNAパネル677遺伝子の全980遺伝子を解析します。DNAパネルでは、高度変異や染色体コピー数異常などを調べることができ、RNAパネルでは、融合遺伝子やエクソンスキッピング、特定遺伝子の発現量などを調べることができます。保険診療の対象ではありません。

Oncomine Target test システム

　Oncomine Target test システムは、治療標的となる遺伝子や治療選択に有益な遺伝子を調べることに特化した小型パネルを使用したがん遺伝子パネル検査です。46の遺伝子パネルを搭載し、がん細胞のDNAを解析することで35の遺伝子変異を調べることができます。また、がん細胞のRNAを解析することで、ALKやROS1をはじめとした21個の融合遺伝子を調べることができます。少量の検体でも、検査ができるのが特徴です。

コンパニオン診断

　コンパニオン診断は、遺伝子変化を標的とした治療薬の効果や副作用を予測するための検査です。がんの遺伝子変化の種類によって医薬品による治療効果が変わるため、薬剤に対して有効な遺伝子異常を有しているかどうかを事前に予測する目的で用いられます。